雖然房地合一稅已實施幾年，但仍有消費者因對稅制的不了解而未能符合規定，比如說，有些屋主虧損出售，誤以為沒有所得就不需要申報，以及不清楚土地出售是否要申報，一小心恐會受罰鍰處分。
信義代書表示，房地合一稅於2016年1月1日後實施，該日以後取得的房屋和土地，以及2014年1月2日以後取得的房屋和土地，且該房屋、土地的持有期間在2年內者，房屋、土地完成所有權移轉登記日之次日起30天內主動申報所得稅。根據規定，持有不到一年出售，要課45%的最高稅率；超過1年，未逾2年課35%；超過2年、未逾10年課20%；持有超過10年則課10%。
雖已實施數年，仍有民眾因不清楚相關規定而不符合規定。日前財政部高雄國稅局發稿指出，發現納稅義務人交易於2016年1月1日以後取得之房屋、土地，誤以為無交易所得就不用申報個人房地合一所得稅而遭受罰鍰處分。
依所得稅法規定，不論有無應納稅額，應於房屋、土地完成所有權移轉登記日之次日起算30日內自行填具申報書。
信義代書提醒，也有部分民眾以為繳納土地增值稅就無須繳納所得稅，房地合一課徵稅負計算公式為「房地收入－成本－費用－依土地稅法計算之土地漲價總數額」，不論房屋和土地出售所得都要課稅，必須計算房屋、土地全部實際獲利，並減除已課徵土地增值稅的土地漲價總數額，針對餘額部分來課徵所得稅，其中的房屋和土地都必須依實價課稅。
舉例說明，陳小姐於2016年6月購買電梯大樓三房，購入成本為1300萬元，於2017年以2000 萬元出售時，繳納自用土地增值稅10萬元(土地漲價100萬元計算)，以及因取得或移轉而支付的費用為150萬元，交易所得及課稅所得計算 如下：房屋、土地交易所得＝成交總價2000萬元－原始取得成本1300萬元－因取得及移轉而支付的費用150萬元＝550萬元，課稅所得＝房屋、土地交易所得550萬元－土地漲價總數額100萬元＝450萬元。
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